NAPO beschikt over verschillende commissies die de onafhankelijkheid van NAPO onderstrepen. Deze commissies zijn:

Commissie Overleg Overheid (COO)
De COO heeft als doelstelling het overleg met de overheid te voeren waar het betreft regelgeving voor au pairs en gastgezinnen.

Commissie Arbitrage (CA)
Mocht een au pair en/of gastgezin het niet eens zijn met de werkwijze van een lid van NAPO kan men zich richten tot deze commissie. De CA zal aan de hand van de reglementen van NAPO een oordeel uitspreken in aangelegenheden die problemen hebben veroorzaakt tussen gastgezin / au pair ten opzichte van het lid. De CA wordt per individueel geval in het leven geroepen en bestaat uit 3 leden van de NAPO. Het lid dat in de aangelegenheid is betrokken maakt nimmer deel uit van de CA.
NOOT: de CA spreekt zich niet uit over enig financieel geschil tussen het gastgezin / au pair ten opzichte van het NAPO-lid. Arbitrage aangelegenheden worden getoetst aan de vigerende reglementen van NAPO.

Commissie Reglementen (CR)
Deze commissie is verantwoordelijk voor de richtlijnen van de au pair en het gastgezin. Zij toetsen de nieuwe leden aan werkwijze en afhandelingsmethode. De CR draagt zorg voor o.a. de tekst van de au pair overeenkomst, de bewustwordingsverklaring en het toelatingsreglement van NAPO. De CR werkt binnen de Wettelijk gestelde voorwaarden en draagt er daarnaast voor zorg dat de reglementen en contracten voldoen aan etische normen en waarden.

Commissie Evenementen (CE)
NAPO organiseert meerdere malen per jaar zogenaamde Nationale NAPO Au Pair Dagen (zie agenda). De organisatie van deze dagen is in handen van de CE. Uitsluitend au pairs geplaatst door NAPO au pair bureaus kunnen deelnemen aan deze dagen. Door de loop der jaren zijn inmiddels tal van dit soort evenementen georganiseerd waardoor de au pair in de gelegenheid wordt gesteld het sociale netwerk verder uit te breiden, contact te leggen met au pairs in de eigen regio en typische Nederlandse plaatsen of bezienswaardigheden te leren kennen.